Rapport for Gruppe for Forskningstjenester (FT) 2015

Gruppe for forskningstjenester har ansvar for løsninger, IT-tjenester, rådgiving og avansert brukerstøtte til universitetes forskere og forskningsmiljøer innen metodiske hovedretninger. Gruppen har derfor et bredt spekter av tjenester og utviklingsprosjekt som vi holder på med, her har vi oppsummert hovedmilæpæler og tiltak for 2015 gruppert pr mål. Videre har vi estimert grovt arbeidsmengden som ligger i de ulike oppgavene.

Ressursoversikt

 
    Stillingsbrøk Stillingsbrøk Stillingsbrøk Stillingsbrøk Ressursavtale med gruppe (stillingsbrøk)
Mål 1 : Produksjonssette og administrerer en
velfungerende tjeneste for Sensitive Data (inkl deltakelse i Tryggve) samt daglig drift
GT,MFI,NP,AA 50% 100% 100% 100% Mange grupper ved USIT (TSD-tjenestegruppeavtale) og 2 x 50% av en FTE mot Elixir
Mål 2 : Videreutvikle og administrere Lifeportal i samsvar med
handlinsplan for Lifeportal (avstemt med Notur/RFK)
GT,NV,KM 10% 50% 50%   Samarbeid med Elixir Oslo og Elixir.no
Mål 3 : Fortsette godt samarbeid med NorStore og EUDAT datalagring, deling og data-mgmt RON 100%        
Mål 5 : Utrede LIMS for UIO AK 50%       AK jobber 50 for LIMs prosjektet ca 1.8.2014 - 1.8.2015
Oppdukkende mål / administrasjon GT 40%        
Vegard Korvald og Martin Benoninsen er avgitt til andre grupper ifbm TSD (hhv GFS og GD) VK,MB 100 100      

Mål #1: Tjenester for Sensitive Data

Beskrivelse:https://www.usit.uio.no/prosjekter/tsd20/

Resultatmål #1: Etablering av tjenestegruppe for TSD  (ferdig)

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Prosjektet TSD skal avsluttes, TSD-utvikling opprettes (PL G. Thomassen og TSD tjenestegruppe opprettes (leder M.F. Iozzi)

Ressurser: Hans A Eide, Gard Thomassen, Maria Francesca Iozzi, Nihal Perera

Status : Ferdig

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når TSD-tjenstegruppe ressursavtale er ok 1.3.15 GT

GT

4 8 12 Ferdig
M2 Når TSD har fått etablert en tjenestegruppe 1.7.15 GT/HAE GT, MFI, NP 4 8 12 Ferdig

 

Resultatmål #2: Utvikle og tilby tjenester for lyd og video i TSD (ferdig)

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Se https://www.usit.uio.no/prosjekter/tsd-utvikling/

Ressurser: Gard Thomassen, Martin Benoninsen, Vegard Korvald, med støtte fra SV-IT, virt-core og GFS

Status : Ferdig

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når vi har proof of concept på VDI riggen for analyse 1.4.15 GT

MB, VK

4 8 12 Ferdig
M2 Når vi har proof of concept på opptakstjenesten ved PSI 1.5.15 GT GT, MB, VK 4 8 12 Ferdig
M3 Når opptak og analyse er testet og funnet brukbart av sluttbruker 15.6.15 GT   4 8 12 Ferdig
M4 Når videoløsningen for TSD er i produksjon for testmiljøene 1.8.15 GT GT, MB, VK 4 8 12 Sluttføres nå

 

Resultatmål #3: Journalsystem for PSI i TSD (jfr kontrakt; ferdig)

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Se https://www.usit.uio.no/prosjekter/tsd-utvikling/

Ressurser: 1 FTE med varighet 1/8-14 til 1/8-15. Arbeidet fordeles på Anne Grethe Knudsen og Robert Frøseth i GAD

Status : Ferdig, i produksjon, men ønsker om videreutvikling eksisterer.

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når Journal er på plass på utsiden av TSD i testmiljø 1.3.15 GT

AGK,RF

4 8 12 Ferdig
M2 Når Journal er testet og funnet ok i testmiljøet 1.4.15 GT AGK,RF, PSI 4 8 12 Ferdig
M3 Når Journal er på plass i oversatt versjon inne i TSD klar for testing 1.6.15 GT AGK,RF 4 8 12 Ferdig
M4 Når Journalsystem for PSI er etablert, testet og prodsatt
i TSD
1.8.15 GT GT 4 8 12 Ferdig

 

Resultatmål #4: Galaxy tilgjengelig i TSD (Tryggve)

Ansvarlig: Maria F. Iozzi

Beskrivelse:  Se https://www.usit.uio.no/prosjekter/tsd-utvikling/

Ressurser: Maria F. Iozzi og Abdulrahman Azab

Status : Fungerer og er prodsatt i p21, testes snart i p65 og venter ellers på RHEL7 i TSD som igjen er avhengig av FirewallD som har vist seg noe trublete i andre sites. Det er også dukket opp uforutsette utfordringer med Galaxy og SLURM i TSD grunnet diskorganiseringen, omlegging er under utarbeidelse. Vi er altså forsinket.

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når vi har fungerende installasjonsopplegg for Galaxy med SLURM interaksjon i TSD 1.5.15 MFI

AA

4 8 12 POC er på plass i p21
M2 Når vi har fungerende tools til tsd-galaxy levert via Docker-containers 1.7.15 MFI AA 4 8 12 POC er på plass i p21
M3 Når prosjekt enkelt kan få prodsatt en Galaxy VM med SLURM integrasjon i TSD 31.12.15 MFI AA 4 8 12 Forsinket

 

Resultatmål #5: Klinisk bruk av TSD (ihht kontrakt, ferdig)

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Se https://www.usit.uio.no/prosjekter/tsd-utvikling/

Ressurser: Gard Thomassen

Status : Ferdig ihht rammen, copy-paste som var en add-on ligger nå hos OUS PVO til avklaring (ferdigstilles T1 2016)

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når TSD har levert tilfredstillende for klinisk bruk ved OUS/AMG 31.7.15 GT

GT, MF, NP

4 8 12 Gard avgitt til prosjektgruppen, kontrakt under utarbeidelse

 

Resultatmål #7:  Invariant lagring og kopling TSD-Cristin (porteføljemidler)

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse:Se https://www.usit.uio.no/prosjekter/tsd-utvikling/

Ressurser: Porteføljemidler, ingen øremerkede personer enda

Status : Forsinket grunnet sen nyansettelse og også forsinket grunnet samarbeidet med Cristin og deres prioriteringer. Planen er noe omorganisert til å omfatte NorStore og Difi fremfor TSD, og Leon i FT er utførende person. Vi overfører midler til 2016.

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når arbeidsoppgaver er avklart med Cristin 1.5.15 GT/HAE

 

4 8 12 Ferdig
M2 Når USIT/TSD oppgavene er utført ihht plan 1.9.15 GT/HAE   4 8 12 Igangsatt (LdT)
M3 Når TSD invariant og Kopling til Cristin er klar 31.12.15 GT/HAE   4 8 12 Avventer Cristin

 

Mål #2: Utvikle portaltjenestene

Beskrivelse: Lifeportal

Resultatmål #1:  Etablere language analysis portal (LAP)

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Etter malen Lifeportal har FT og FI sammen med Prof. Oepen ved IFI oppretet Language Analysis Portal, veldig lik Lifeportal, men selvfølgelig med sprpkforskningsverktøy istedet for bioinformatiske verktøy.

Ressurser: Nikolay Vazov, Katerina Michalickova, Thomas Roblitz

Status : Jfr USITs del av jobben er LAP nå i produksjon, dog ikke offisielt fra Clarino Norge.

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når LAP er i produksjon Q1 2015 GT

NV, KM, TR

4 8 12 Ferdig T2 2015

 

Resultatmål #2: Utvikle og etablere GeoPortal

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Etter malene Lifeportal og LAP har FT og FI sammen med Inst. for Geofag begynt å lage en Geoportal, dette spesielt for å understøtte versjonskontroll, datahåndtering og reproduserbarhet.

Ressurser: Nikolay Vazov, Katerina Michalickova, Thomas Roblitz

Status : Noe forsinket grunnet Sigma2 avtaler om portaler mangler, Anne på Geo skal slutte, men fra USITs side er leveransene på plass.

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når sluttrapport er levert Sigma2 31.12.15 GT

TR, KM, NV

4 8 12 Testportal overlevert til GEO 1 mai 2015

 

Resultatmål #3: Hardware for Lifeportal (porteføljemidler)

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Lifeportal´en vil være veldig tjent med dedikert hardware for kjøring av småjobber, dette vil gi en ekstremt mye bedre brukeropplevelse både for vanlig bruk og i kurssistuasjon. Porteføljesøknad for 2015 har gitt tilslag på midler til HW.

Ressurser: Nikolay Vazov, FI

Status : HW bestillt, får ikke ferdig installasjon før T1 2016

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når Lifeportal har dedikert hw for frontend og småjobber i produksjon 31.12.15 GT

NV

4 8 12 Innkjøpet er noe forsinket, men med overlegg. Forskjøvet frist til 31/12-15.

 

Resultatmål #4: Portalsamarbeid ved UiO

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Elixir.uio.no og Hyperbrowser.uio.no er portalen på Galaxy-rammeverket som driftes av bioinformatikere på IFI

Ressurser: Nikolay Vazov, Katerina Michalickova, Thomas Roblitz, Abdulrahman Azab

Status : Konseptuelt avklart merge av Lifeportal og Elixir Oslo portal, frister og ansvar er ikke avklart enda, vi mener å være i rute. Avhenger noe av punktet over, og skyves til 2016.

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når Lifeportal og Elixirportalen/Hyperbrowser er omforent om årets mål 1.2.15 HAE, GT, TR

HAE, GT, TR, KM, NV. AA + Elixir

4 8 12 Avklart
M2 Når Lifeportal og Elixir/HB er samlet om et koderepo og en versjons av Galaxy 1.3.15 GT HAE, GT, TR, KM, NV. AA + Elixir 4 8 12 På plass
M3 Når Lifeportal og Elixir har samlet seg på en portal med SLURM og dedikert HW 1.10.15 GT HAE, GT, TR, KM, NV. AA + Elixir 4 8 12 Avhengig av Elixir, forsinket
M4 Når LP og Elixir er avstemt om sine Portal-ideer Life-science  mål er realisert 31.12.15 HAE, GT HAE, GT, TR, KM, NV. AA + Elixir 4 8 12 Avhengig av Elixir

Mål #3: Generell drift/bistand, ledelse og oppdukkende mål

Beskrivelse: Dette målet er for å kunne sørge for ledelse av aktiviteter og bistand ved spesielle prioriterte oppdukkende behov

Resultatmål #1: Støtte av GIS mot UiO

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: TF er ansvarlige for at nødvendiog GIS software er tilgjengelig for UIO

Ressurser: Roger O Nordby

Status : Levert ihht bestillinger

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når GIS støtten har vært tilfredstillende for 2015 31.12.15 GT

RON

4 8 12  

 

Resultatmål #2: Bistand og utvikling for NorStore

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: FT bistår Norstore med utvikling av lagrings- og arkiv-tjenestene.

Ressurser: Roger O Nordby

Status : Levert ihht bestillinger

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når NorStore får levert ihht SLA for 2015 31.12.15 GT/HAE

FMI, RON

4 8 12  

 

Resultatmål #3: Bistand NoTur

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: FT bistår brukere i Notur sammenheng, spesielt mtp Abel.

Ressurser: Roger O Nordby, Abdulrahaman Azab, Katerina Michalickova, Nikolai Vazov

Status : Levert ihht bestilling

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når Notur får levert ihht SLA for 2015 31.12.15 GT

KM, NV, RON

4 8 12  

 

 

Resultatmål #4: FI/FT kursuke

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: FT/FI avholder kursuke årlig for vitenskaplig databehandling.

Ressurser: Katarina Michalickova, Nikolay Vazov, Gard Thomassen, Roger O Nordby, Sabry R

Status : Levert ihht plan

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når FT/FI kursuke har blitt avholdt tilfredsstillende i 2015 31.12.15 GT/HAE

KM, NV, RON, PF, PH

4 8 12  Våren 2015 gikk fint

 

 

Mål #4: LIMS utredning for USIT (porteføljemidler 2014)

Beskrivelse: Det er i mange forskergrupper ved UIO, særlig innen Life Science, behov for Laboratory Information Management System. USIT ved ITf fikk porteføljemidler for 2014 til å utrede behovet for LIMS, tilbudet av tilgjengelige LIMS´er samt å komme med en anbefaling på hvorvidt USIT bør tilby å drifte LIMS for forskergrupper ved UIO, og isåfall hvilke(n) LIMS.

Resultatmål #1: Utredning av Laboratory Information Management System for USIT, UIO (porteføljemidler, ferdig)

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Se https://www.usit.uio.no/prosjekter/lims/

Ressurser: Anders Kielland har 50% stilling fra 1/8-14 til 1/8-15

Status : Sluttrapport levert ihht plan, anbefaling levert IT-dir. ITF har estimert ressursbehovet tilknyttet å tilby LIMS (LabKey Server) bredt ved UiO.

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når LIMS utredningsrapport er levert og godkjent hos UAIT ledelse 1.8.15

GT/HAE

AK

4 8 12 Ferdig

 

Mål #5: Instrumentnett for UIO

Beskrivelse: 

Resultatmål #1: Etablere instrumentnett ved UIO slik at sært matriell som krevere eldre OS eller lignende kan få dette tilbudt uten å kompromittere IT-sikkerheten.

Ansvarlig: Gard Thomassen

Beskrivelse: Ulike typer instrumenter ved UIO fordrer eldre OS enn vha UIO ønsker å tilby i sitt vanlige åpne nett. Dette medfører et behov for et instrumentnett-system som muliggjør fortsatt bruk av instrumenter som krever OS som er utenfor UIOs standard driftsregime.
Se http://www.usit.uio.no/prosjekter/instrumentnett/mandat/ for detaljer.

Ressurser: Avhengig av Underavdeling for drift, Kickoffmøte planlagt 29/5 for å kartlegge behovet.

Status : Noe forsinket, nettene er på plass, det må avholdes et Styringsgruppemøte snart og et prosjektmøte. Cert / IT-sikkerhet skal sette opp proxy og GAD skal få opp TS. Retningslinjer er laget for konseptet fra IT-sikkerhet, vi har ikke oppdaget nye behov ifht eksisterende plan etter runde 2 med behovskartlegging (etter oppfordring fra Styringsgruppen). Se prosjektrapport

Milepæler:
# Milepæl Frist Ansvarlig Deltakere Status Kommentar
M1 Når behovsanalyser fra tidligere forsøk er kartlagt 1.3.15 GT

?

4 8 12 Ferdig 7/7-15
M2 Når ressursbehov og avtaler er på plass 1.6.15   ? 4 8 12 Forsinket
M3 Når løsningsalternativ er kartlagt, valgt og godkjent av IT-drift og IT-sikkerhet     ? 4 8 12 Forsinket
M4 Når valgt løsning er implementert 1.10.15 GT ? 4 8 12 Forsinket
M5 Når instrumentnettet er testet og godkjent 1.11.15 GT ? 4 8 12 Forsinket
M6 Når instrumentetnettet er i produksjon 31.12.15 GT ? 4 8 12 Forsinket

 

 

Av Gard Thomassen
Publisert 21. jan. 2015 14:30 - Sist endret 2. feb. 2016 12:48